בשנת 1997 הוכרה החצר הפנימית בכפר הנער בן שמן ע"י המועצה הלאומית לשימור אתרים כאתר מורשת לתקומה לאומית ולשימור. כאן החלה הציונות המעשית בניסיונות ליזום ולייסד מפעלים ציוניים ראשוניים וייחודיים מאז קניית אדמות בית עריף ע"י בנק אפ"ק בשנת 1904: בבן שמן ייסד נחום וילבוש ב-1905 את בית חרושת תעשייתי ראשוני להפקת שמן זית, "עתיד". בשנת 1906 ישראל בלקינד בנה את החצר הפנימית ובה יסד את ביה"ס "קריית ספר" – ביה"ס לעבודת האדמה. בשנת 1908 הוקמה המשתלה לעצי זית לנטיעת יער הרצל במסגרת פרוייקט הייעור הלאומי. במקום זה הוקמה חווה חקלאית בניהולו של יצחק וילקנסקי -וולקני (1909-1922) להכשרת חקלאים ולפיתוח חקלאות מודרנית. ביוזמתו של וילקנסקי נוסד בחווה בשנת 1921 מכון לחקלאות-תחנת ניסיון חקלאית אשר בגלגוליו השונים הפך למכון וולקני. בחוות בן שמן החל המחקר החקלאי המודרני. בשנת 1910 ייסד בוריס שץ (מייסד מכללת "בצלאל" בירושלים) את "מושבת בצלאל בבן שמן", לצורפים עולי תימן. בשנת 1920 הקימה קבוצת וותיקי פועלי החווה את מושב העובדים בן שמן (המושב הישן) בשטח "מושבת בצלאל". בחצר הפנימית פעל בשנת 1926-27 משק הפועלות בראשות עדה פישמן-מימון. בשנת 1927 קיבל ד"ר להמן את "החצר הפנימית" והאדמות סביבה והקים את כפר הנוער בן שמן. כפר הנוער בן שמן הוקם על פי חזונו, רעיונותיו, תפיסותיו ומשנתו החינוכית של ד"ר להמן אשר היה הוגה דעות פרקטי - איש עשייה ויוצר חינוכי. ד"ר להמן הגיע לארץ עם נערים/רות יתומים מבית הילדים בקובנה שבליטא. תוך זמן קצר הצטרפו ילדים ונערים ילידי הארץ ומחו"ל יוצאי תנועות הנוער הציוניות ומספרם הגיע לכמה מאות. בשנות הארבעים התחנכו בכפר מעל 500 חניכים וחניכות והיה לאחד מכפרי הנוער הגדולים בעולם. היום כאשר הכפר מתקרב לשנת ה- 100 להיווסדו, מתחנכים בו קרוב ל - 400 תלמידי פנימייה, ונשמרים באדיקות העקרונות / היסודות החינוכיים: חינוך לפלורליזם, לאהבת הארץ, לעבודת האדמה ולחיים חברתיים, בצד טיפוח הפרט והישגיו האישיים. בארכיון ובמוזיאתר שהוקמו בחצר הפנימית ניתן למצוא אלפי תמונות ומסמכים סרוקים ומתוייקים המשמשים תלמידים וסטודנטים לעבודות מחקר. כמו כן, המקום מארח קבוצות מכל קצוות הארץ לסיורי מורשת, ומשמש מרכז מידע לבוגרי הכפר ולמשפחותיהם.