מחלקת כתבי היד והמכון לתצלומי כתבי יד עבריים
המכון לתצלומי כתבי יד עבריים בספרייה הלאומית אוסף עותקים של כל כתבי היד העבריים, המצויים באוספים ציבוריים ופרטיים ברחבי הארץ והעולם. יותר מ-76,000 סלילים ואלפי סריקות דיגיטליות, המייצגים יותר מ-90% של כתבי היד העבריים הידועים, זמינים לשימושם של חוקרים ומתעניינים. בנוסף, מאחסנת המחלקה 11,000 כתבי יד עבריים מקוריים, ויותר מ-2,000 כתבי יד בשפות המזרח ובשפות ממשפחת הלשונות הרומאניות.
לצד מחלקת כתבי יד והמכון לתצלומי כתבי יד עבריים מתקיים מפעל הפליאוגרפיה העברית, שבו נערכים מחקרים קודיקולוגיים ופליאוגרפיים של כתבי יד עבריים מימי הביניים. בזאת מציעה הספרייה הלאומית לחוקרים ולמתעניינים שירותים ייחודים למחקרים והשוואות של כתבי יד עבריים, שנמצאו במקומות שונים ברחבי העולם. משאבים מודפסים ודיגיטליים אלו בתחומי היהדות והעברית זמינים תחת קורת גג אחת.